こんにちは。
一度、CNCjsのコンソールで$3だけをもう一度打ってみてください。
$3=7が反映されていれば $3=7 と表示されるはずです。
もしパラメータが反映されていない場合、何か入力が間違っていた可能性があります。
すべて半角でもう一度入力し直してみてください。
もし、すでに$3=7だった場合、$3=0にして様子をみてみてください
ちなみにモーターの反転方法はパラメータを変更する他にも、モーターの配線を入れ替える方法があります。
CNCxPROの場合、A+、A-を互いに入れ替えるか、B+、B-を互いに入れ替えれば逆向きに回転するかと思います。