こんにちは
どういう状態でストップしたのかが分からないのでなんとも言えませんが、
CNCjsの一時停止ボタンを押して手動で止めたのであれば復帰ボタンを押せば再開すると思います。
何らかのエラーが発生しロックされたのであれば，NCプログラムの送信は止まります。
そしてリセットやアンロックをかけた際にNCプログラムの送信状態もリセットされます。そのため、再度実行を行うとNCプログラムが最初から流れ、プログラムの内容によっては正しくない位置に行くかもしれません。
CNCjsにはNCプログラムの指定位置からのスタートという機能はなかったと思います。
もし加工の途中から再開させたいという場合は以下の方法が考えられます。
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CAMの設定ですでに加工した部分を除外しパスを再出力して使う
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既存のNCプログラムを修正して加工途中の座標から始める
参考（NCプログラムを編集して再開する場合）
https://wiki.shapeoko.com/index.php/FAQ#Continuing_a_cut_which_is_interrupted
ちなみにCNCjsではなくUGSでは指定行からの実行の機能があるようです