こんにちは
Gymさんのアドバイスに加えてですが
まずはモーターの配線を確認をしてみて、問題がなさそうであればZ軸のモーターの電流量を変更すると改善が見られるかもしれません。
CNCxPRO v5の場合、$142
がZのモーター駆動時の電流量、$152
がZの停止時に位置を保持するときのモーター電流量を指定するパラメーターです。
モーターの定格の範囲内で調節してみてください。(Avalontechのモーターの場合、小さいモーターは2.8A、大きいタイプのモーターは3.0AがMAXです)